Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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