Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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VcanQ62059 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VcanQ62059 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
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