Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms