Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms