Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sec31aQ3UPL0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sec31aQ3UPL0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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