Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hdgfl2Q3UMU9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hdgfl2Q3UMU9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.1 ms