Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edc4Q3UJB9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms