Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Puf60Q3UEB3 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Puf60Q3UEB3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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