Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf166Q3U9F6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf166Q3U9F6 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms