Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms