Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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