Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms