Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Cntn3Q07409 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Cntn3Q07409 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Cntn3Q07409 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Cntn3Q07409 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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