Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms