Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms