Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SmsP97355 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SmsP97355 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SmsP97355 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms