Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RhodP97348 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RhodP97348 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms