Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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