Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Polr2iP60898 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms