Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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