Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CntfP51642 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CntfP51642 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CntfP51642 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CntfP51642 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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