Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RorcP51450 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms