Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Srp9P49962 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms