Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RpiaP47968 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms