Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrprbP47758 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrprbP47758 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms