Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxc11P31313 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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