Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BgnP28653 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BgnP28653 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BgnP28653 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BgnP28653 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms