Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rpl3P27659 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl3P27659 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms