Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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