Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18533 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18533 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18533 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms