Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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P18530 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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P18530 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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P18530 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P18530 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms