Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P10404 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms