Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprcP06800 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprcP06800 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprcP06800 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms