Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms