Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20830J3KML6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms