Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms