Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms