Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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