Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms