Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms