Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ssxb8B1AY40 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ssxb8B1AY40 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssxb8B1AY40 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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