Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms