Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms