Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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