Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psma1Q9R1P4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms