Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pole3Q9JKP7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pole3Q9JKP7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pole3Q9JKP7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pole3Q9JKP7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pole3Q9JKP7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms