Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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