Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Smg9Q9DB90 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Smg9Q9DB90 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Smg9Q9DB90 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smg9Q9DB90 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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