Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rrp8Q9DB85 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rrp8Q9DB85 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rrp8Q9DB85 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rrp8Q9DB85 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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