Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zbed3Q9D0L1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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